新疆大学自1978年起开始招收硕士研究生，1981年经国务院批准成为首批具有硕士学位授予权高校，1996年获批博士学位授予权。学校现有14个博士学位授权一级学科、37个硕士学位授权一级学科及1个博士专业学位类别，涵盖了高级专门人才培养和科学研究的主要领域。学校自获批招收研究生以来，已累计招收学历教育硕士研究生34243人、学历教育博士研究生1790人，招收非学历教育硕士研究生3093人，为国家和自治区改革开放、经济社会发展输送了大批高层次人才。 （数据截止至2023年3月）

博士招生学科及专业学位类别

理论经济学

经济与管理学院

马克思主义理论

马克思主义学院

中国语言文学

中国语言文学学院

数学与系统科学学院

物理科学与技术学院

地理科学学院

生命科学与技术学院

生态与环境学院

机械工程学院

电气工程学院

计算机科学与技术

信息科学与技术学院

化学工程与技术

085700

资源与环境

地理科学学院、

生态与环境学院、

化工学院、

地质与矿业工程学院、

建筑工程学院