1941年，为增进中印两国之谅解，余协中应军委会国际问题研究所之约，以休假教授名义赴印讲学。旅印8个月，足迹遍及 加尔各答 、 新德里 、孟买、 拉合尔 、加什米尔、饶并狄。除在各大学讲演外，并对当时印度各党派及人物之政策与思想加以研究。时甘地与 尼赫鲁 均在狱中。 尼赫鲁 致函请其季妹哈青逊夫人与余协中接洽。在孟卖两人多次会谈。在新德里，余协中又同甘地长、次二子会见。由印返国后，根据调查所得，写成报告呈军委会，就印度国内形势和中印邦交之发展趋向，提出了有益的见解。 此后，余协中曾为战后和平问题在《 大公报 》发表一篇社论，获考试院院长 戴传贤 的赞赏，被邀任中央考试院参事，并兼任中央政治学校特别讲演。1944年，被调任两广、湘、赣、闽五省讲演。 抗战胜利后，余协中应 杜聿明 之邀，往沈阳任东北九省保安司令部秘书长。其时， 杜聿明 与东北九省主席会商，开办东北 中正大学 。余协中初任该校文学院长，继任该校校长。 辽沈战役 前夕，该校学生多奔赴石家庄，投身革命，学校无法开办。余协中将学校移交教育部后，携眷赴沪，旋又由沪赴港。1957年，携眷赴美定居。 余协中好学多才，知识渊博，写有史学方面的著述。二子均受优良教育而各有所成。 长子 余英时 ，1961年得 哈佛大学 博士后，先后任密西根大学、哈佛大学教授。1973年应 香港中文大学 之聘，返港任 新亚书院 校长兼中文大学副校长。1974年，任 台湾中央研究院 院士。现任美国 普林斯顿大学 教授。近年致力于中国思想史之研究，为国际知名之史学家、哲学家。海峡两岸留美学者，很多出自其门下。中西文专著百数十种，如《汉代中外经济交通》、《 方以智晚节考 》、《 论戴震与章学诚 》、《 历史与思想 》、《近代史学与传统》、《中国知识阶层史论》、《文化评论与中国》等，不少著作已再版多次。 次子余英华，美国密西根大学哲学博士，毕业后即执教于密西根大学。擅长逻辑学、知识论。因教学成绩优异，密西根大学破例提前给予终身职位。亦有著作出版问世。