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2009年,获北京大学医学部优秀人才奖;

饶毅、张大庆、黎润红著,呦呦有蒿:屠呦呦与青蒿素,获中国出版协会2015年度中国30本好书奖;获2016年第四届中国科普协会优秀作品金奖;

《医学人文学导论》获2014年北京市第十三届哲学社会科学优秀成果奖;

《科学编年史》获2014年上海市自然科学成果二等奖,主要完成人。