致命的错误：cuda.h。没有这样的文件或目录

正确的包含头文件不是 cuda.h ，而是 cuda_runtime.h ，假设你想使用 gcc 作为这段代码的编译器。 正如其他答案所指出的，你可以直接使用 nvcc （它已经安装在你的机器上），这根本不需要为这段代码提供任何包含头文件。

如果你想使用 nvcc ，你可能应该确保设置了适当的 PATH 环境变量。 这些信息和其他有用的信息都包含在 linux安装指南 .

So if you modify your code like this:

#include <cuda_runtime.h>
int main ()
    int deviceCount;
    cudaError_t e = cudaGetDeviceCount(&deviceCount);
    return e == cudaSuccess ? deviceCount : -1;
你应该能够使用类似这样的命令成功地编译它。
gcc -I/usr/local/cuda/include -L/usr/local/cuda/lib64 has_cuda.c -lcudart -o has_cuda
在-I开关之后的路径应该包含你机器上的cuda_runtime.h的路径。  通常情况下，应该像上面那样设置，但我不确定你的机器上是否设置了cuda的符号链接，而且看起来你的include目录可能在一个不同的地方，即
/usr/local/cuda-8.0/targets/x86_64-linux/include
但你可以使用find，就像你一直在做的那样来定位它。
同样，-L开关后的路径需要是你的cudalib64目录的路径，它将包含libcudart.so和它的亲属。  同样，这通常是在我显示的路径上的符号链接，但你的机器安装可能不符合我的期望。  你应该能够使用find来定位正确的路径。
而正如另一个答案所指出的，如果你使用nvcc（你已经找到了），你将不需要明确选择-I和-L的路径。  最简单的方法是将你的文件从has_cuda.c重命名为has_cuda.cu，然后你应该可以像这样进行编译。
nvcc has_cuda.cu -o has_cuda
最后，Ubuntu 16.10目前还不是官方支持的CUDA发行版，所以它在你的机器上的安装方式可能会有一些意外。  我鼓励你阅读之前链接的安装指南，因为它包含了关于安装后设置步骤的有用信息，例如设置环境变量，以及如何 "验证 "CUDA的安装。
任何时候你在运行CUDA代码时，如果遇到任何问题，确保使用适当的cuda错误检查并用cuda-memcheck运行你的代码，像这样。
cuda-memcheck ./has_cuda
即使你不理解报告的错误信息，也可能对试图帮助你的人有用。