cd circos-0.69-9/example/
../bin/circos -conf etc/circos.conf
运行成功之后,会在当前目录生成circos.png和circos.svg两张图片。
参考:
生信 | Circos的安装 - 简书 (jianshu.com)
1 C
irc
os
简介
C
irc
os
是一个非常酷炫的基因组数据可视化软件,能够将基因组数据映射到环形的基因组坐标上,用相互嵌套的环道来展示基因组数据,还可以通过连接线来呈现基因组区块之间的关系。C
irc
os
的开发者是一位加拿大的生物信息学家Martin Krzywinski,值得一提的是,他还是一位专业的摄影师。于是,科学和艺术的交融,催生了C
irc
os
这款强大的可视化软件,果真不懂艺术的码农不是好的生物学家。
自从C
irc
os
诞生以后,圈图就成了生物信息可视化的明星图形,不时见诸顶尖杂志的文章。尽管有意见
C
irc
us项目CLI工具详解:c
irc
us-top与c
irc
usctl
使用
指南
C
irc
us是一个强大的进程管理工具,它提供了丰富的命令行工具来帮助开发者和管理员监控和管理进程。本文将重点介绍C
irc
us项目中两个核心的CLI工具:c
irc
us-top和c
irc
usctl,帮助读者全面掌握它们的特性和
使用
方法。
c
irc
us-top:实时监控工具
c
irc
us-top是C
irc
us提供的实...
C
irc
os
是一种环状图表,最初用于基因组学中的基因关系可视化,后来逐渐发展为广泛应用于各类多维数据展示的工具,它以圆形扇区为核心,不同的类别或维度可以分配到各个扇区中,每个扇区内可以绘制多个图形轨道,从而能够在同一图表中显示多种图形类型。数据可视化是数据分析中的重要环节,尤其是在面对多维数据时,如何有效地展示各类特征及其之间的关系是一项挑战,接下来将介绍一种独特且高效的可视化工具——C
irc
os
,它以环形布局为基础,能够清晰、直观地展示不同类别、维度的复杂数据结构。C
irc
os
可视化的基本原理。
是那个基于perl的C
irc
os
Mac/
Linux
的安装可以参考之前的文章【传送门】Window安装会有点麻烦01官网教程必读内容这不是一个手把手教程,所以如果想解c
irc
os
的
使用
,推荐...
目录安装准备文件karyotypeconf文件作图获取tutorial压缩包制作自己的第一个图
利用conda安装c
irc
os
是最简单的(perl安装各个依赖包的过程比较繁琐)
#创建虚拟环境
conda create -n c
irc
os
python=3.7
#激活虚拟环境
conda activate c
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os
#安装c
irc
os
conda install -c bioconda c
irc
os
#测试c
irc
os
c
irc
os
--modules
看到下面这些提示左侧全部为ok即可(按照以
Galaxy生信云平台 UseGalaxy.cn 新增c
irc
os
圈图绘制工具。Graph/Display DataC
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os
visualizes data in a c
irc
ular layout (Galaxy Version 0.69.8+galaxy12)C
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os
(Krzywinski等人,2009年)是一个用于以圆形布局可视化数据的软件包。这使得C
irc
os
非常适合探索对象或位置...
是一个基于 Python 的进程管理工具,它可以帮助你轻松地管理和监控你的应用程序和服务。
C
irc
us 可以用来做什么?
C
irc
us 可以用来管理任何基于 Python 的应用程序或服务。例如,你可以
使用
C
irc
us 来管理你的 Web 应用程序、数据库
服务器
、消息队列等等。C
irc
us 提供了一个简单的命令行接口,可以让你轻松地启动、停止和监...
当矩形图无法满足要求的时候,我们就要掰弯它。
c
irc
os
图是出现在各大期刊上的概率大大提高了,这不仅仅因为它好看,其次C
irc
os
还能同时展示出不能类型的数据。
一、C
irc
os
的安装
1、conda安装
通过conda search c
irc
os
,我们可以看到有很多个c
irc
os
版本,因此我们无论安装哪个版本都是可以的。conda软件的安装在前面的文章中已经具体讲解。
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