cd circos-0.69-9/example/
../bin/circos -conf etc/circos.conf

运行成功之后,会在当前目录生成circos.png和circos.svg两张图片。

参考: 生信 | Circos的安装 - 简书 (jianshu.com)

1 C irc os 简介 C irc os 是一个非常酷炫的基因组数据可视化软件,能够将基因组数据映射到环形的基因组坐标上,用相互嵌套的环道来展示基因组数据,还可以通过连接线来呈现基因组区块之间的关系。C irc os 的开发者是一位加拿大的生物信息学家Martin Krzywinski,值得一提的是,他还是一位专业的摄影师。于是,科学和艺术的交融,催生了C irc os 这款强大的可视化软件,果真不懂艺术的码农不是好的生物学家。 自从C irc os 诞生以后,圈图就成了生物信息可视化的明星图形,不时见诸顶尖杂志的文章。尽管有意见 C irc us项目CLI工具详解:c irc us-top与c irc usctl 使用 指南 C irc us是一个强大的进程管理工具,它提供了丰富的命令行工具来帮助开发者和管理员监控和管理进程。本文将重点介绍C irc us项目中两个核心的CLI工具:c irc us-top和c irc usctl,帮助读者全面掌握它们的特性和 使用 方法。 c irc us-top:实时监控工具 c irc us-top是C irc us提供的实... C irc os 是一种环状图表,最初用于基因组学中的基因关系可视化,后来逐渐发展为广泛应用于各类多维数据展示的工具,它以圆形扇区为核心,不同的类别或维度可以分配到各个扇区中,每个扇区内可以绘制多个图形轨道,从而能够在同一图表中显示多种图形类型。数据可视化是数据分析中的重要环节,尤其是在面对多维数据时,如何有效地展示各类特征及其之间的关系是一项挑战,接下来将介绍一种独特且高效的可视化工具——C irc os ,它以环形布局为基础,能够清晰、直观地展示不同类别、维度的复杂数据结构。C irc os 可视化的基本原理。 是那个基于perl的C irc os Mac/ Linux 的安装可以参考之前的文章【传送门】Window安装会有点麻烦01官网教程必读内容这不是一个手把手教程,所以如果想解c irc os 使用 ,推荐... 目录安装准备文件karyotypeconf文件作图获取tutorial压缩包制作自己的第一个图 利用conda安装c irc os 是最简单的(perl安装各个依赖包的过程比较繁琐) #创建虚拟环境 conda create -n c irc os python=3.7 #激活虚拟环境 conda activate c irc os #安装c irc os conda install -c bioconda c irc os #测试c irc os c irc os --modules 看到下面这些提示左侧全部为ok即可(按照以 Galaxy生信云平台 UseGalaxy.cn 新增c irc os 圈图绘制工具。Graph/Display DataC irc os visualizes data in a c irc ular layout (Galaxy Version 0.69.8+galaxy12)C irc os (Krzywinski等人,2009年)是一个用于以圆形布局可视化数据的软件包。这使得C irc os 非常适合探索对象或位置... 是一个基于 Python 的进程管理工具,它可以帮助你轻松地管理和监控你的应用程序和服务。 C irc us 可以用来做什么? C irc us 可以用来管理任何基于 Python 的应用程序或服务。例如,你可以 使用 C irc us 来管理你的 Web 应用程序、数据库 服务器 、消息队列等等。C irc us 提供了一个简单的命令行接口,可以让你轻松地启动、停止和监... 当矩形图无法满足要求的时候,我们就要掰弯它。 c irc os 图是出现在各大期刊上的概率大大提高了,这不仅仅因为它好看,其次C irc os 还能同时展示出不能类型的数据。 一、C irc os 的安装 1、conda安装 通过conda search c irc os ,我们可以看到有很多个c irc os 版本,因此我们无论安装哪个版本都是可以的。conda软件的安装在前面的文章中已经具体讲解。 [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-iGohKlon-1615