患者只需吞下如維他命丸的膠囊內鏡，它就會如微型潛艇般漫遊人體，隨腸蠕動前進，膠囊內鏡一秒可拍攝兩張影像，在八小時的過程，共拍得超過六萬張相，最後會串成一個如影片的檔案，而膠囊內鏡最後會自行排出體外。
目前有三種不同的膠囊內鏡，分別應用於食道、小腸及大腸。食道的膠囊有兩個鏡頭，可以一前一後拍攝每秒 14 張影像；而大腸膠囊亦有兩組鏡頭，當進入胃部後 3 分鐘就會先關閉，而在一小時後再拍攝大腸的情況。
要補充一點，膠囊內視鏡僅作檢查用途，如發現小腸出血或有癌前病變，便需進一步以小腸鏡抽取組織進行化驗，又或利用手術把腫瘤切除。
醫生會向病人解釋檢查的原因、過程及可能出現之併發症，病人明白後便可簽署同意書。
病人應告知醫生及護士所有以往病歷、曾進行過的手術、最近所服用的藥物及因藥物而引致的併發症。
請於檢查前七天停服含鐵補充劑。
術前
6小時
禁止飲食。
腸道必須乾淨。
請遵照醫生之指示，並按時飲用潔腸劑及注意飲食及潔腸指引。
為免影響感應貼的黏性、請勿在腹部搽抹潤膚露或香粉。如有需要，應按護士指示剃去腹部肚臍上下約十五厘米範圍的體毛。
請勿塗唇膏或潤唇膏，以免影響影像質素。
請穿著寬身上衣(女士請勿穿著連身裙)。
請在預約時間到達內視鏡檢查中心。
檢查前，護士會在病人身上不同部位貼上接收儀器，並在腰間戴上數據記錄儀；
病人以水送服一粒膠囊內視鏡，醫護人員會用監控儀器確認膠囊內視鏡已進入病人胃部；
在吞服膠囊約 2 個小時後，護士會定時檢視膠囊的位置，並跟據醫生的指示作出安排。
約 4 小時後，當護士鑒定膠囊已進入小腸，可依照護士指示進食少量食物。
檢查期間，可自由活動；但仍須依照護士指示，準時回到內視鏡中心檢視膠囊的位置。
自由活動期間，需每隔 15 分鐘查看數據記錄儀的指示燈是否有藍色閃爍，確保每秒閃爍兩次。
(緊記 - 不要靠近强電磁場源，例如 MRI 設備或非專業無綫電設備(如路由器)等。)
為免影響記錄數據，在此期間請不要拆除記錄儀設備或將腰帶取下，避免數據記錄儀突然受到移動或遭受重擊。
於膠囊內視鏡排出前，不能接近任何強力電磁區域，如磁力共振儀器。
如在檢查過程中出現腹痛、噁心或嘔吐等現象，應立即回到內視鏡中心聯絡醫生或護士跟進。
當膠囊從體內排出後表示膠囊內視鏡檢查結束。
請依時回到內視鏡中心，護士會替病人取下資料記錄儀，並進行資料處理。
在檢查結束及退回所有儀器兩小時後，便可恢復正常飲食及活動。
