戚继光率部进入台州城, 与倭寇展开了激烈的巷战。 戚继光将本来十一人为一组的鸳鸯阵子阵, 变成了三人一组的三才阵、 六人一组的两仪阵, 依然是遵循着狼筅、 盾牌、 长枪的三三组合。 长谷堪助和大内晴英率残部逃走, 向次郎被诛, 台州大捷。 胜利后, 戚继光率领全军, 给阵亡的将士举行了庄严的海葬礼。 台州大捷后, 戚继光成为了当朝第一红人, 言官御史们开始弹劾戚继光拥兵自重。戚继光早已深谙官场凶险, 他将军队托付给性情稳重的赵大河, 进京面圣。 戚继光进京的举动, 皇帝竟然没有责怪, 立刻接见了戚继光。 君臣二人倾心交谈, 嘉靖御赐了新军“戚家军”的称号, 却也提出了难题, 戚家军需要自己解决军费问题。 戚继光抛出了攻克福建横屿岛的策略, 那里是倭寇的金库。

戚继光下令杨文亲自检查六十门虎蹲炮, 胡守仁检查军需, 而陈大成则负责带着兵士好好休息准备作战。 长谷堪助的手下抓了上岛探查的兵士, 对他严刑拷打, 试图问出戚继光的计划。 俞大猷求见福建巡抚请他出兵一起助戚继光打倭寇, 但巡抚生怕丢官拒不见俞大猷, 俞大猷对巡抚不出步兵表示理解, 但他称福建水师一定要出兵助戚继光一臂之力。林雪在营地中发现了虎蹲炮, 她将虎蹲炮的样式、 规格画成图纸, 用信鸽传给了长谷堪助。 战斗伊始, 长谷堪助故意示弱, 把戚家军放入了岸防炮射程。 当戚继光使出虎蹲炮的时候, 长谷堪助突然命令岸防炮以远标尺射击。 危急时刻, 俞大猷率领福建水师到达, 压制住了岸防炮。 戚继光撤下大部分行动迟缓的重装部队, 亲自率领一千精锐冲击泥滩, 夺岛成功。

胡宗宪留下遗愿，要求徐渭一定替自己完成《筹海图编》。胡宗宪用血在狱中墙上画下了大明的海岸线后自杀。就在戚继光准备冲进狱中之时，徐渭含泪出来了，他代为转达了胡宗宪的遗愿。戚继光猛然间明白了，自己得替胡宗宪、替那些为了抗倭事业献出生命的人继续活下去，直到海波清平。王昱竹的父亲本是个好官，但也牵扯进了严党案，被定了罪。王昱竹写下休书，离开了戚继光。这样一来，戚继光将不会因为王家获罪而被诛连。王昱竹独自回到了黄县水城，她独自望着苍茫大海，丝毫不悔。此刻的戚家军，被困在了浙江动弹不得。新任的浙江巡抚拘泥死板，将戚继光认作胡宗宪一党，不肯放半点权力。福建兴化府城遭到围困，明军向广东求援。冈川信在城外杀死了广东总兵派来的信使，一众倭寇化装成明军士兵，欲蒙混入城。

倭寇里应外合，夺取了兴化。这是自嘉靖朝倭患以来，第一个失守的府城。朝廷震怒，福建巡抚被革职查办，谭纶接替福建巡抚。福建战事一天天危急。继兴化府城失守后，平海卫也落入倭寇之手，敌人形成了坚固的犄角防御。戚继光做出了人生中最凶险的决定，戚家军在没有得到任何一级命令的情况下，从浙江开拔了。倭寇埋伏在戚继光行军途中，意欲半路而击，给戚家军一个下马威，却不料遭遇了奉命奔赴平海卫的欧阳深和僧兵队伍。作战中，倭寇渐渐不敌僧兵，此时戚继光赶到，将这伙倭寇全部剿灭。戚继光得知欧阳深奉命增援平海卫，二人同路而行。谭纶召集戚继光、俞大猷、欧阳深等将领商讨攻打平海卫的策略，除非有人能潜入城中，里应外合。欧阳深深明大义，主动请缨。

欧阳深成功地完成了打开城门的任务，但以身殉国。攻下平海卫后，嘉靖拟旨恢复了戚继光的职务，并令其出兵福建。戚继光点齐兵马，策划毕其功于一役，收复兴化，消灭长谷堪助。戚继光布置了一个冒险的战略，他命杨文、林雪等率主力绕过兴化府，作为一支被隐藏起来的主攻部队，于赤血滩集结;以自己为诱饵，打着帅旗直奔赤血滩，吸引长谷堪助主力，待到戚家军主力到达，一举将其包围歼灭。长谷堪助通过林雪得知了戚继光的作战计划，打算将计就计，带主力突袭赤血滩，并命冈川信带人马去林墩北侧埋伏，阻挡戚家军主力。戚家军主力被林雪设计带到了地势不利的山区，遭到了冈川信的突袭。杨文一时间无法突破防御，被困在了林墩。此刻，戚继光和赵大河所带领的诱军在赤血滩遭到了长谷堪助主力的攻击，情形已是十万火急。戚继光在兵力上处于绝对劣势，只能凭借着鸳鸯阵的强大防御能力，勉强支撑着。